作物缺锰时，首先在新生叶脉间失绿黄化，而叶脉和叶脉附近仍保持绿色，脉纹较清晰。 保持绿色，脉纹较清晰。严重缺锰时，叶面脉间出现黑褐色细斑点，进而斑点增多扩大，遍及整个叶片。 不同作物缺锰的症状及易发部位有所不同。
1.大、小麦缺锰症状
苗期植株黄化，叶脉间退绿形成条纹花叶，并于叶脉间出现褐色斑点，逐渐斑点扩展连成线状或片状，直至枯死。常于离叶基 1/3~ 1/2 处背折下垂，使株形披散纷乱。在拔节到幼穗分化期症状表现最典型，分蘖少，生育停滞。
2.水稻缺锰症状
从叶尖开始向叶的基部发展，形成失绿条纹，叶基部变褐色，严重时坏死，新生叶宽短，呈淡绿色，植株矮小。
3.甜菜缺锰症状
生长初期叶片直立，呈三角状，叶脉间严重失绿，称为黄斑病。 叶缘向内卷缩，严重缺锰时叶片坏死。
4.葡萄缺锰症状
多发生在开花后，缺锰时叶脉间失绿黄化，果实着色不一致，葡萄串中常夹杂青粒，光泽较差。作物缺锰最典型的是豌豆杂斑病、燕麦灰斑病、甜菜黄斑病。缺锰还可加重块茎疮痂病，苹果树缺锰表现为粗皮病等。一些作物如番茄、谷类作物、甘蓝、甜菜、菠菜、李子、草莓等缺锰首先出现在老叶；而另一些作物如亚麻、马铃薯、烟 草、棉花、柑橘、可可等则在幼叶上首先出现缺锰症状。